Τομείς του ενδιαφέροντος και της ερευνητικής δραστηριότητας του εργαστηρίου αποτελούν η ταυτοποίηση και ο μοριακός χαρακτηρισμός παθογόνων αιτιών ιολογικών ασθενειών που προσβάλλουν τα λαχανικά και την άμπελο με έμφαση στις νέες/αναδυόμενες ασθένειες, η ανάπτυξη και βελτίωση μοριακών δοκιμών διάγνωσης και χαρακτηρισμού φυτικών ιών και ιοειδών (PCR, IC-RT-PCR, PCR, Real-Time PCR) και η ανάπτυξη καινοτόμων διαγνωστικών μεθόδων αποτελεσματικού εργαστηριακού ελέγχου της φυτοϋγείας πολλαπλασιαστικού υλικού αμπέλου. Επιπλέον ερευνητικοί άξονες αποτελούν η μελέτη της γενετικής παραλλακτικότητας και εξέλιξης των παθογόνων αιτιών ιολογικών ασθενειών, η χαρτογράφηση της παρουσίας τους στον Ελλαδικό χώρο, η μελέτη των αλληλεπιδράσεων φυτών ξενιστών-ιών-φορέων για την βαθύτερη κατανόηση της βιολογίας των ιών, με στόχο την αποτελεσματικότερη αντιμετώπιση τους.